Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zic1P46684 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zic1P46684 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zic1P46684 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zic1P46684 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms