Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlx1P43345 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlx1P43345 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms