Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HttP42859 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HttP42859 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HttP42859 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HttP42859 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HttP42859 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HttP42859 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HttP42859 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HttP42859 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HttP42859 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HttP42859 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HttP42859 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HttP42859 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HttP42859 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HttP42859 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HttP42859 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HttP42859 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HttP42859 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HttP42859 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HttP42859 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HttP42859 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HttP42859 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HttP42859 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HttP42859 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HttP42859 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HttP42859 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HttP42859 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HttP42859 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HttP42859 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HttP42859 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HttP42859 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms