Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LifrP42703 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LifrP42703 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LifrP42703 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LifrP42703 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LifrP42703 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LifrP42703 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LifrP42703 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LifrP42703 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LifrP42703 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LifrP42703 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LifrP42703 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LifrP42703 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LifrP42703 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LifrP42703 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LifrP42703 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LifrP42703 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LifrP42703 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LifrP42703 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LifrP42703 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LifrP42703 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LifrP42703 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LifrP42703 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LifrP42703 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LifrP42703 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LifrP42703 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LifrP42703 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LifrP42703 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LifrP42703 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LifrP42703 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LifrP42703 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LifrP42703 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LifrP42703 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LifrP42703 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LifrP42703 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LifrP42703 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LifrP42703 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LifrP42703 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LifrP42703 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms