Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac1P41539 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac1P41539 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms