Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Csf3rP40223 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csf3rP40223 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms