Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sar1aP36536 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sar1aP36536 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms