Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TpoP35419 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TpoP35419 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TpoP35419 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TpoP35419 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TpoP35419 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TpoP35419 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TpoP35419 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TpoP35419 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TpoP35419 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TpoP35419 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TpoP35419 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TpoP35419 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TpoP35419 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TpoP35419 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TpoP35419 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TpoP35419 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TpoP35419 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TpoP35419 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TpoP35419 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TpoP35419 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TpoP35419 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TpoP35419 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms