Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5cP35278 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5cP35278 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5cP35278 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5cP35278 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5cP35278 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5cP35278 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rab5cP35278 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rab5cP35278 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rab5cP35278 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5cP35278 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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