Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pola1P33609 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pola1P33609 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pola1P33609 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pola1P33609 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pola1P33609 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pola1P33609 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms