Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd1P33215 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nedd1P33215 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms