Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gsx2P31316 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms