Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk4P30285 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk4P30285 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms