Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OatP29758 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OatP29758 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OatP29758 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OatP29758 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OatP29758 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OatP29758 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OatP29758 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OatP29758 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OatP29758 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OatP29758 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OatP29758 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OatP29758 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OatP29758 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OatP29758 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OatP29758 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OatP29758 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OatP29758 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OatP29758 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OatP29758 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OatP29758 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OatP29758 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OatP29758 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OatP29758 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OatP29758 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OatP29758 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OatP29758 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OatP29758 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OatP29758 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OatP29758 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OatP29758 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OatP29758 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OatP29758 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OatP29758 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OatP29758 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OatP29758 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms