Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pabpc1P29341 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pabpc1P29341 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms