Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TbpP29037 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TbpP29037 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TbpP29037 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TbpP29037 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TbpP29037 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TbpP29037 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TbpP29037 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TbpP29037 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms