Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp3P28862 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp3P28862 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms