Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1bP28334 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1bP28334 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htr1bP28334 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms