Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja8P28236 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gja8P28236 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja8P28236 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms