Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjc1P28229 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjc1P28229 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjc1P28229 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms