Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-DMaP28078 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms