Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl6P27784 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms