Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tgfb2P27090 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb2P27090 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tgfb2P27090 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.6 ms