Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Twist1P26687 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Twist1P26687 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms