Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfraP26618 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfraP26618 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms