Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxd11P23813 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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