Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsta3P23591 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tsta3P23591 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsta3P23591 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms