Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja1P23242 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja1P23242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja1P23242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja1P23242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja1P23242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja1P23242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms