Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ms4a2P20490 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a2P20490 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms