Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SagP20443 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SagP20443 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SagP20443 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SagP20443 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SagP20443 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SagP20443 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SagP20443 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SagP20443 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SagP20443 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SagP20443 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SagP20443 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SagP20443 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SagP20443 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SagP20443 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SagP20443 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SagP20443 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SagP20443 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SagP20443 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SagP20443 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SagP20443 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms