Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou5f1P20263 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou5f1P20263 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms