Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trap1aP19473 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trap1aP19473 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms