Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18530 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18530 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18530 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18530 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18530 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18530 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18530 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18530 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18530 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18530 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18530 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18530 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18530 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18530 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18530 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18530 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P18530 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms