Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptbp1P17225 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptbp1P17225 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms