Protein–RNA interactions for Protein: P16872

Il7r, Interleukin-7 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il7rP16872 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Il7rP16872 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Il7rP16872 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Il7rP16872 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Il7rP16872 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms