Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcna1P16388 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms