Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp53P15975 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp53P15975 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp53P15975 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp53P15975 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp53P15975 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms