Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd44P15379 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd44P15379 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd44P15379 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms