Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sub1P11031 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sub1P11031 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sub1P11031 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms