Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd8bP10300 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms