Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Schip1P0DPB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Schip1P0DPB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms