Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CatspereP0DP43 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms