Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde6gP09174 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6gP09174 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms