Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb1P09055 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb1P09055 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb1P09055 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms