Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NeflP08551 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NeflP08551 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NeflP08551 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NeflP08551 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NeflP08551 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NeflP08551 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NeflP08551 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NeflP08551 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NeflP08551 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NeflP08551 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NeflP08551 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NeflP08551 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NeflP08551 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NeflP08551 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NeflP08551 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NeflP08551 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NeflP08551 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NeflP08551 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NeflP08551 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NeflP08551 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NeflP08551 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NeflP08551 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NeflP08551 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NeflP08551 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NeflP08551 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NeflP08551 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NeflP08551 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NeflP08551 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NeflP08551 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NeflP08551 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NeflP08551 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NeflP08551 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NeflP08551 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NeflP08551 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NeflP08551 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NeflP08551 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NeflP08551 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms