Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp1P08042 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp1P08042 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms