Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnfP06804 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnfP06804 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnfP06804 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnfP06804 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnfP06804 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnfP06804 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnfP06804 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnfP06804 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnfP06804 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnfP06804 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnfP06804 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnfP06804 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnfP06804 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnfP06804 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TnfP06804 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnfP06804 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnfP06804 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TnfP06804 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnfP06804 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TnfP06804 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnfP06804 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TnfP06804 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnfP06804 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnfP06804 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnfP06804 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnfP06804 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnfP06804 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnfP06804 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnfP06804 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnfP06804 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnfP06804 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnfP06804 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnfP06804 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms