Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Me1P06801 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me1P06801 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Me1P06801 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me1P06801 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me1P06801 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me1P06801 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me1P06801 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me1P06801 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me1P06801 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me1P06801 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me1P06801 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me1P06801 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me1P06801 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me1P06801 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me1P06801 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me1P06801 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me1P06801 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me1P06801 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me1P06801 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms