Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XlrP05531 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XlrP05531 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XlrP05531 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XlrP05531 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XlrP05531 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XlrP05531 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XlrP05531 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XlrP05531 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XlrP05531 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XlrP05531 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XlrP05531 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XlrP05531 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XlrP05531 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
XlrP05531 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XlrP05531 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XlrP05531 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms