Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04214 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04214 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04214 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P04214 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04214 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04214 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04214 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04214 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04214 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P04214 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P04214 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04214 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P04214 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04214 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04214 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04214 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04214 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04214 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P04214 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P04214 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04214 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04214 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04214 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04214 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04214 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04214 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms